e-Biogenouest project

Overview

The e-biogenouest project aims to evaluate development possibility of the Information and communication technologies (ICT, TIC in French) use in life sciences in western France.

Trough the Biogenouest Unifying project process, supported by Brittany and Pays de la Loire regions, it started May 2012 and will run for 2 years under the coordination of Olivier Collin (GenOuest Bioinformatics core facility & CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA) and the animation of Yvan Le Bras (GenOuest Bioinformatics core facility & CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA).

Quelques ressources pour présenter le projet e-Biogenouest, l'environnement virtuel de recherche et les outils adaptés pour les communautés des sciences de la vie du Grand Ouest

Article original accepté à JOBIM 2013, présentant l' Environnement Virtuel de Recherche (VRE) test déployé : Towards a Life Sciences Virtual Research Environment: An e-Science initiative in Western France. Cet article nous sert de livre blanc dans le cadre du projet Le support de la présentation orale effectuée lors de JOBIM 2013 sous format pdf : Présentation orale JOBIM 2013 Présentation synthétique du projet e-Biogenouest sous format pdf : Présentation synthétique du projet e-Biogenouest Présentation du projet eBiogenouest sous format pdf : Projet eBiogenouest

Quelques vidéos réalisées pour présenter l'environnement virtuel de recherche et le HUB eBGO

La vidéo diffusée en tant que support de la présentation orale faite à JOBIM 2013 : eBGO HUB: From Idea to Data and Metadata Management. Cette vidéo de 10 minutes permet de présenter les fonctionnalités de l'environnement de test déployé, proposant au scientifique du Grand Ouest d'effectuer au mieux les différentes tâches d'un projet de recherche Une très courte vidéo (1 min. 41 sec ) présentant une overview du HUB eBGO : e-biogenouest HUB overview Une vidéo de près de 9 minutes présentant les outils proposés pour la gestion et l'analyse des données via le HUB eBGO : eBGO HUB: Analyse and Manage your data

Four Work Packages

In a first inventory step will highlight western france life sciences caracteristics in term of ICT access, control and use

-Actions referencing

-Available resources identification (computing power, network, software ...)

-Inventory of e-research initiatives

 

An important part of this multi disciplinary project is the animation

-Community management

-Education

 

The project builds on severals tools

-Collaborative tool : this HUB

-Analysis tools : based on web portal like Mobyle or Galaxy

-Manage a directory

-Create an inventory tools

 

Endly, create and update a master plan